تعیین توالی سریع ژنوم حیاتی است. چرا ما در این مورد بد هستیم و چه کاری می توان انجام داد؟

[ad_1]

چرا تعیین توالی ژن بسیار مهم است؟

تعیین توالی اثبات می کند که نمونه مورد مطالعه از نژاد اصلی ویروس ووهان چه تغییری کرده است و اینکه آیا جهش در یک ژن خاص منجر به آلودگی بالاتر می شود. این امر ، به عنوان مثال ، قفل کردن یا نبودن آن را به اطلاع سیاست می رساند ، و همچنین برای طراحی واکسن های موثرتر از اهمیت برخوردار است.

بهترین روش جهانی برای تعیین توالی چیست؟

بهترین استراتژی توالی 5٪ از کل نمونه های مثبت Covid است. انگلیس در اینجا مسابقه را رهبری می کند. وب سایت کنسرسیوم Covid-19 Genomics UK می گوید که 5،69،877 ویروس تاکنون توالی یابی شده اند و نمودارهای روزانه آن به وضوح ظهور نوع Delta (B.1.617.2) را به عنوان غالب ترین نوع ثبت می کند. سایر کشورهای پیشرفته مانند ایالات متحده و استرالیا نیز 5٪ یا بیشتر از نمونه های مثبت را توزیع کرده اند.

هند چگونه می گذرد؟

نظارت ژنوم هند Covid-19 ، که توسط موسسه ژنومیک و زیست شناسی تلفیقی CSIR در دهلی انجام می شود ، می گوید که تا 21 ژوئن ، 30483 ژنوم به طور عمده برای پروژه نظارت INSACOG Covid و پروژه GENESCoV2 دولت کرالا توالی می شد. این بخش کوچکی از موارد Covid 3 کروری است که از ماه مارس سال 2020 در هند کشف شده است. انصافاً برای دانشمندان درگیر ، هند نظارت خود را از دسامبر 2020 به طور جدی آغاز کرد.

آنوراگ آگراوال ، مدیر IGIB می گوید که قانون 5٪ مدتی است که برنامه INSACOG نیست. وی گفت این ایده انجام “نمونه برداری ثابت بر اساس زمان و جغرافیا” بعلاوه نمونه برداری استراتژیک “عمیق تر” در صورت لزوم است. از او معمولاً “توالی هوشمند” را ترویج کرده اند.

چه کاستی هایی در رویکرد هند وجود دارد؟

برخی از جامعه علمی ترس از آن دارند که به جای نمونه گیری “علمی” ، نمونه های مثبت برای تعیین توالی به طور تصادفی انتخاب شود. Nerges Mistry بنیاد تحقیقات پزشکی مستقر در بمبئی ، با اعتبار پیشگام در ژنومی سل ، طرفدار آزمایش خوشه ای است: اگر تعدادی از موارد در یک منطقه جغرافیایی کوچک – مثلاً یک مدرسه یا یک ساختمان مسکونی – وجود داشته باشد ، بنابراین این نیاز وجود دارد 80٪ از نمونه های مثبت این منطقه را برای تعیین توالی انتخاب کنید تا بفهمید آیا یک واریانت در کار است یا خیر.

نگرانی دیگر این است که تمرکز ویژه ای روی آسیب پذیرترین زیر گروه بیماران وجود ندارد – کسانی که تحت درمان Covid قرار می گیرند در حالی که تحت درمان بیماری های بزرگ هستند. متخصصان می گویند چنین بیمارانی “بهترین” مخزن ویروس SARS-CoV-2 برای طولانی تر شدن و شروع جهش ها برای تقویت بقای آن است.

بعلاوه ، انتقادات گسترده ای از طرف جامعه علمی در مورد طناب زنی در بخش خصوصی برای تسریع در پروژه تعیین توالی وجود دارد.

چه چیزی مانع ما می شود؟ منابع مالی؟ زیر ساخت؟

بودجه یک مشکل است. هنگامی که کنسرسیوم INSACOG از 10 آزمایشگاه نخبگان تحقیقاتی حدود شش ماه پیش برای انجام تعیین توالی Covid ایجاد شد ، مرکز 115 کرور روپیه را برای یک دوره شش ماهه در نظر گرفت. این تخصیص صورت نگرفت و از بخش بیوتکنولوژی خواسته شد که این کنسرسیوم را از منابع خود تأمین کند.

تعیین توالی ژن گران است. در بخش خصوصی ، آزمایش های ژنومیک برای بررسی اختلالات (از جمله بیماری های سبک زندگی و سرطان) به ده ها هزار روپیه می رسد. فناوری های جدیدی که امکان توالی یکباره تعداد زیادی از نمونه ها را فراهم می کند ، می تواند هزینه ها را به زیر 5000 روپیه برساند ، اما چنین ارتقااتی هنوز انجام نشده است. هزینه های مكرر معرف ها (بعضی از آنها باید وارد شوند) نیز نگران كننده است.

مشکل دوم ظرفیت است. در حالی که IGIB توانایی انجام 10،000 توالی در ماه را دارد ، اما در مورد ظرفیت آزمایشگاه های دیگر وضوح وجود ندارد. توالی ها انجام کارها نسبتاً ساده هستند ، اما با توجه به حجم هند و تعداد زیادی از بیماران ، دانشمندان معتقدند که بخش خصوصی باید برای این منظور درگیر شود.

تدارکات نیز یک کابوس است. اینکه چقدر سریع می توان نمونه های مناطق روستایی را به آزمایشگاه های تعیین توالی منتقل کرد ، مسئله ای است.

سریعترین راهها برای بهبود تلاشهای هند کدامند؟

یک راه حل طناب زدن در آزمایشگاه های دیگر با دانش فنی برای توالی بیشتر است. پیشنهاد دیگر ایجاد ارتباط است: آزمایشگاه های محلی کوچکتر می توانند روند کار را شروع کرده و یک نمونه پایدارتر را برای انجام آزمایش نهایی و تشخیص به آزمایشگاه های بزرگتر منتقل کنند.

سپس گزینه شروع نظارت بر فاضلاب وجود دارد که ارزان تر از توالی فردی است ، حداقل در شهرهای پر بار مانند بمبئی و دهلی. IIT Gandhinagar اخیراً از طریق شناسایی مواد ژنتیکی SARS-CoV-2 نظارت بر فاضلاب خود را برای Covid به نمایش گذاشت.



لینک شده


سلب مسئولیت

نظرات بیان شده در بالا از نظر نویسنده است.



پایان مقاله


  • پزشکان در مقابل رامدف: برای مبارزه با کوید به علم احتیاج دارید ، نه خرافات

  • بیدار شوید ، مهمانی بزرگ و بزرگ: احزاب منطقه ای به یک کل پان هند اضافه نمی شوند. مخالفت شدیداً به تجدید نظر در کنگره نیاز دارد

  • طرز تفکر دیکتاتوری منجر به اضطراری شد: اما ریشه های دموکراسی عمیق تر شده است ، هیچ کس در آینده جرات دخالت در حقوق اساسی شهروندان را ندارد

  • کنگره باید توجه داشته باشد: مردم احزاب را ترک نمی کنند ، آنها رئیسان را ترک می کنند

  • مراقب تله توییتر باشید: شبکه های اجتماعی حواس پرتی است ، از این صدا و عصبانیت سزاوار نیست ، چه از طرف دولتمردان و چه از رسانه ها

  • نگاه طولانی از لاداخ: درس گالوان این است که هند به متحدان خود در برابر چین نیاز دارد. سه نوع اتحاد امکان پذیر است

  • قانون مدنی یکنواخت: آن را به یک تمرین سکولار تبدیل کنید

  • بگذارید آنها بخورند … یک کشور متنوع رژیم های متنوعی خواهد داشت. سیاست در مورد غذا برای سلامت ملی مضر است

  • شکاف در قلعه پکن: جزیره ، نابرابری ، انطباق ، اختلاف با همسایگان – اینها باعث شدند آمریکا شماره 1 نشود

  • جایگاه هند در Quad به توانایی آن در مقابله با چین و نه کوید بستگی دارد

Leave a reply

You may use these HTML tags and attributes: <a href="" title=""> <abbr title=""> <acronym title=""> <b> <blockquote cite=""> <cite> <code> <del datetime=""> <em> <i> <q cite=""> <s> <strike> <strong>